如何从ZINC数据库下载小分子用于虚拟筛选

    科技2025-05-19  38

    ZINC改版了,最新版跟几年前我用的版本大不一样,于是查了一下资料,整理了一个教程

    参考视频:https://www.youtube.com/watch?v=zloEnrWGqAg

    1.点击Tranches,可以看到有很多选项,根据需求选择合适的分类,点击下载,我选择sdf格式的下载,下载方式选择powershell,将文件下载到桌面,放在screening文件夹里,并修改文件名为ligands.ps1;

    2.开始菜单栏输入Powershell,右键,以管理员身份运行;

    3.切换文件夹,输入ls,看users文件夹中的所有文件夹;

    然后cd "想进入的文件夹名"

    最后cd Desktop进入桌面文件夹

    cd Screening进入筛选文件夹

    输入ls,看screening文件夹里面有什么;

    输入Set-ExecutionPolicy Unrestricted

    选择 Yes to all

    输入.\ligands.ps1,回车后,选择run once;

    完成后,输入Set-ExecutionPolicy Unrestricted

    3.以上步骤会在Screening文件夹下生成新的文件夹,视频中是两个,也可能更多

    新建文件夹ligands

    搜索框输入.gz

    打开解压缩工具ExtractNow

    将文件拖入ExtractNow

    点击Extract,选择ligands文件夹,点击Ok to all。

    打开ligands文件夹,里面的文件就是下载的sdf格式

     

    Processed: 0.010, SQL: 8